Staatssecretaris Zijlstra van OC&W heeft naar de Kamer zijn reactie gestuurd op het rapport van Rathenau waaruit blijkt dat het budget voor directe uitgaven voor R&D van de overheid met € 0,7 miljard daalt (€ 5,1 miljard in 2010 > € 4,4 miljard in 2016). Deze daling wordt met name veroorzaakt door het aflopen van de innovatieprogramma’s, het beëindigen van de additionele voeding uit het Fes en de rijksbrede subsidie- en apparaatstaakstellingen. Na correctie voor de crisis-maatregelen 2009 en 2010 resteert een daling van € 0,5 miljard. Tegenover de daling in directe uitgaven staat volgens de staatssecretaris een forse stijging van de indirecte uitgaven van de rijksoverheid voor onderzoek en ontwikkeling. De verschuiving van de uitgaven voor onderzoek is het gevolg van de keuzes die in het regeerakkoord zijn gemaakt om specifiek beleid via subsidies af te bouwen en generiek beleid te ontwikkelen via fiscale stimulering en het beschikbaar stellen van risicokapitaal met het innovatiefonds. Het kabinet steunt onderzoek en ontwikkeling via de fiscaliteit (WBSO, RDA en RDA+, Innovatiebox), met het innovatiefonds en door publieke en private partijen intensiever met elkaar te laten samenwerken aan onderzoek en innovatie in de topsectorenaanpak. Hiermee worden ook investeringen van bedrijven zelf in
onderzoek aangemoedigd. Eén van de grootste problemen op dit vlak is namelijk het laten toenemen van de investeringen van bedrijven in R&D. Volgens de staatssecretaris kun je voor een eerlijke vergelijking van de uitgaven voor kennis en innovatie je beter richten op het precrisisjaar 2008. Hierdoor ontstaat een betere vergelijking omdat in dat jaar geen sprake was van tijdelijke crisismaatregelen en omdat in de jaren daarna het BBP door de crisis is gedaald. Bij een vergelijking van 2016 ten opzichte van 2008 is er inclusief fiscale faciliteiten (exclusief Innovatiebox) sprake van een stijging van de publieke
financiering van R&D. De stijging in absolute zin gaat van € 5,1 miljard in 2008 naar € 5,7 miljard in 2016, wat neerkomt op een stijging van 0,86% van het BBP in 2008 tot naar verwachting 0,90% van het BBP in 2016.